При прыжке в порт, корабль выходит из игры , затем снова заходит, но уже на другой карте. В процессе этого мы имеем свободный интервал времени 2-3 секунды. За это время я , например, успеваю сменить напополам конфигурацию ( т.е 2 прыжка и новая конфа готова ) добавить процессор, либо наоборот убрать что-то лишнее.
Продвинутые же пользователи могут могут с помощью определенного макроса ( или еще чего-либо ) мгновенно менять конфу после прыжка в порт.